El proyecto que tuvo origen en la Cámara de Senadores, busca generar mayor participación de las organizaciones civiles, como las cooperadoras escolares, universidades, centros de estudiantes entre otros grupos sociales.
En tanto que la versión de Diputados propone que el Consejo esté integrado por: el ministro de Educación y Ciencias; secretario ejecutivo de la Secretaría Técnica de Planificación del Desarrollo Económico y Social; presidente del CONACYT; cuatro personas de reconocida solvencia moral, con experiencia en el área educativa, y que tengan participación en proyectos ejecutados o apoyados por el sector privado, designadas por el presidente la República, a propuesta del CONACYT y; por un representante de las universidades públicas. Propuesta que fue aceptada finalmente.
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