En marzo de 2018 un grupo de concejales de Quyquyhó presentaron una denuncia en la Fiscalía por lesión de confianza contra el exintendente y actual diputado Esteban Samaniego (ANR, Añetete), pero a casi dos años no se pudo imputar o archivar la presentación.
Casi seis meses estuvo la denuncia deambulando por la Fiscalía General del Estado sin que se nombre a un fiscal que atienda el caso, hasta que luego de que los denunciantes urgieran la investigación se designó a la fiscala de Delitos Económicos Marlene González.
Sin embargo, la fiscala ya fue recusada tres veces por el diputado Samaniego, pero confirmada en todas las ocasiones por carecer de fundamentos jurídicos los pedidos para que ella se aparte del expediente. Sin embargo, estas recusaciones hacen que se retrasen las pesquisas y es lo que la defensa del parlamentario persigue, que pase el tiempo y que prescriban los hechos denunciados, sin que se presente una imputación.
El diputado fue denunciado por un faltante en la Municipalidad de Quyquyhó de G. 10.000 millones, de los G. 16.000 millones que administró durante su gestión desde el año 2011 hasta el 2017, cuando renunció para candidatarse a diputado por Paraguarí.
Cuando Samaniego dejó la intendencia, la intendenta interina Isidora Benítez solicitó una auditoría externa que fue efectuada por la Consultora Saliec, representada por la licenciada Ada Torres, que terminó confirmando el faltante.
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